ポケットモンスター ミュウツー! 我ハココニ在リ MEWTWO SAGA

جیووانی، رهبر تیم راکت، میوتو را در منطقه‌ای دورافتاده از ناحیه جوهتو پیدا کرده است. در حالی که او سعی می‌کند دوباره میوتو را اسیر کند، اش و دوستانش هنگام تلاش برای نجات پیکاچو از دست جسی و جیمز، توسط دومینو، عضو جدید تیم راکت، ربوده می‌شوند. پوکمون‌های کلون‌شده نیز اسیر می‌شوند و به عنوان طعمه برای میوتو استفاده می‌شوند. ماجرا به نبردی میان اراده میوتو و جیووانی تبدیل می‌شود؛ و میوتو نیز در پی آن است که بفهمد آیا او و کلون‌ها هدفی در زندگی دارند، حتی با وجود اینکه محصول علم و آزمایش هستند.